Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scn9aQ62205 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn9aQ62205 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Scn9aQ62205 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scn9aQ62205 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scn9aQ62205 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scn9aQ62205 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scn9aQ62205 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scn9aQ62205 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scn9aQ62205 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms