Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema4bQ62179 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema4bQ62179 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema4bQ62179 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms