Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Aldh1a2Q62148 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a2Q62148 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.5 ms