Protein–RNA interactions for Protein: Q61880

Dmc1, Meiotic recombination protein DMC1/LIM15 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dmc1Q61880 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms