Protein–RNA interactions for Protein: Q61880

Dmc1, Meiotic recombination protein DMC1/LIM15 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dmc1Q61880 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dmc1Q61880 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dmc1Q61880 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dmc1Q61880 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dmc1Q61880 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms