Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC31,39■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31,36■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31,36■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31,36■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,61
Gli3Q61602 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC31,3■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31,26■■■□□ 2,6
Gli3Q61602 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC31,26■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31,24■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Gli3Q61602 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC31,2■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31,2■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC31,17■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC31,17■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Gli3Q61602 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC31,13■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC31,13■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,9 ms