Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccne1Q61457 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccne1Q61457 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccne1Q61457 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms