Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd53Q61451 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd53Q61451 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd53Q61451 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms