Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PapolaQ61183 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PapolaQ61183 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PapolaQ61183 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms