Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxf1Q61080 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxf1Q61080 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxf1Q61080 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms