Protein–RNA interactions for Protein: Q61035

Hars, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HarsQ61035 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HarsQ61035 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HarsQ61035 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HarsQ61035 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HarsQ61035 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HarsQ61035 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HarsQ61035 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HarsQ61035 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HarsQ61035 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HarsQ61035 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HarsQ61035 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HarsQ61035 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HarsQ61035 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HarsQ61035 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms