Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TmpoQ61033 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TmpoQ61033 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TmpoQ61033 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TmpoQ61033 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TmpoQ61033 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TmpoQ61033 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TmpoQ61033 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TmpoQ61033 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TmpoQ61033 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TmpoQ61033 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TmpoQ61033 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TmpoQ61033 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TmpoQ61033 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TmpoQ61033 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TmpoQ61033 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TmpoQ61033 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TmpoQ61033 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TmpoQ61033 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms