Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ift20Q61025 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ift20Q61025 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift20Q61025 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms