Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JrkQ60976 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
JrkQ60976 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JrkQ60976 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
JrkQ60976 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JrkQ60976 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
JrkQ60976 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JrkQ60976 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
JrkQ60976 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JrkQ60976 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JrkQ60976 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JrkQ60976 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JrkQ60976 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JrkQ60976 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JrkQ60976 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JrkQ60976 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms