Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp4Q60972 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp4Q60972 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms