Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HellsQ60848 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HellsQ60848 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HellsQ60848 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HellsQ60848 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HellsQ60848 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HellsQ60848 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HellsQ60848 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HellsQ60848 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HellsQ60848 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HellsQ60848 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HellsQ60848 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HellsQ60848 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HellsQ60848 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HellsQ60848 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HellsQ60848 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HellsQ60848 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HellsQ60848 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HellsQ60848 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HellsQ60848 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HellsQ60848 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HellsQ60848 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HellsQ60848 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HellsQ60848 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HellsQ60848 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HellsQ60848 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HellsQ60848 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HellsQ60848 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HellsQ60848 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HellsQ60848 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HellsQ60848 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HellsQ60848 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HellsQ60848 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HellsQ60848 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HellsQ60848 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HellsQ60848 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HellsQ60848 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HellsQ60848 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HellsQ60848 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HellsQ60848 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HellsQ60848 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HellsQ60848 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HellsQ60848 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HellsQ60848 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HellsQ60848 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms