Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rasa3Q60790 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rasa3Q60790 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rasa3Q60790 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rasa3Q60790 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rasa3Q60790 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rasa3Q60790 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rasa3Q60790 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rasa3Q60790 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rasa3Q60790 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rasa3Q60790 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rasa3Q60790 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rasa3Q60790 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rasa3Q60790 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rasa3Q60790 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rasa3Q60790 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms