Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkn2cQ60772 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn2cQ60772 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms