Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn11Q60771 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cldn11Q60771 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms