Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tcf4Q60722 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcf4Q60722 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms