Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pabpn1lQ5XFR0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpn1lQ5XFR0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms