Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tdrd5Q5VCS6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tdrd5Q5VCS6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd5Q5VCS6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tdrd5Q5VCS6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms