Protein–RNA interactions for Protein: Q5UKY4

Cd200r3, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r3Q5UKY4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd200r3Q5UKY4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200r3Q5UKY4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms