Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uimc1Q5U5Q9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uimc1Q5U5Q9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Uimc1Q5U5Q9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms