Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Slc5a6Q5U4D8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc5a6Q5U4D8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a6Q5U4D8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms