Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Med13Q5SWW4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Med13Q5SWW4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med13Q5SWW4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms