Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CluhQ5SW19 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CluhQ5SW19 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CluhQ5SW19 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CluhQ5SW19 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CluhQ5SW19 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CluhQ5SW19 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CluhQ5SW19 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CluhQ5SW19 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms