Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PfasQ5SUR0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PfasQ5SUR0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PfasQ5SUR0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms