Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam46cQ5SSF7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam46cQ5SSF7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam46cQ5SSF7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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