Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trdv4Q5R1A3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv4Q5R1A3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trdv4Q5R1A3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms