Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RilpQ5ND29 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RilpQ5ND29 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RilpQ5ND29 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RilpQ5ND29 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms