Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Nlrc3Q5DU56 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Nlrc3Q5DU56 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrc3Q5DU56 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Nlrc3Q5DU56 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Nlrc3Q5DU56 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Nlrc3Q5DU56 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrc3Q5DU56 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms