Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc8bQ5DU41 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc8bQ5DU41 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc8bQ5DU41 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms