Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2f8Q58FA4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f8Q58FA4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E2f8Q58FA4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2f8Q58FA4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms