Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
L1td1Q587J6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
L1td1Q587J6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1td1Q587J6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
L1td1Q587J6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
L1td1Q587J6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1td1Q587J6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1td1Q587J6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1td1Q587J6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1td1Q587J6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1td1Q587J6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1td1Q587J6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms