Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmtc2Q56A06 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmtc2Q56A06 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmtc2Q56A06 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmtc2Q56A06 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms