Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spire1Q52KF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spire1Q52KF3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Spire1Q52KF3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spire1Q52KF3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms