Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN81

H2-Q2, Histocompatibility 2, Q region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q2Q4KN81 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q2Q4KN81 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q2Q4KN81 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q2Q4KN81 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q2Q4KN81 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q2Q4KN81 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q2Q4KN81 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q2Q4KN81 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q2Q4KN81 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q2Q4KN81 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2-Q2Q4KN81 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q2Q4KN81 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-Q2Q4KN81 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-Q2Q4KN81 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q2Q4KN81 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q2Q4KN81 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q2Q4KN81 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q2Q4KN81 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q2Q4KN81 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q2Q4KN81 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q2Q4KN81 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q2Q4KN81 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q2Q4KN81 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q2Q4KN81 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms