Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5935Q497S0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5935Q497S0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5935Q497S0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5935Q497S0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5935Q497S0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5935Q497S0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5935Q497S0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm5935Q497S0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5935Q497S0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms