Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2al1nQ497L1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms