Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ckap2Q3V1H1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ckap2Q3V1H1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ckap2Q3V1H1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms