Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ulk4Q3V129 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ulk4Q3V129 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ulk4Q3V129 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ulk4Q3V129 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms