Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r3cQ3V0Y1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp4r3cQ3V0Y1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r3cQ3V0Y1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r3cQ3V0Y1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r3cQ3V0Y1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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