Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc9Q3V038 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc9Q3V038 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc9Q3V038 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc9Q3V038 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms