Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UZV7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UZV7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UZV7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UZV7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UZV7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UZV7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UZV7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3UZV7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3UZV7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3UZV7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UZV7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UZV7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UZV7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UZV7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UZV7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UZV7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UZV7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms