Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnpc3Q3UZ01 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnpc3Q3UZ01 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnpc3Q3UZ01 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnpc3Q3UZ01 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms