Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr1d1Q3UV55 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr1d1Q3UV55 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1d1Q3UV55 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1d1Q3UV55 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms