Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prom2Q3UUY6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Prom2Q3UUY6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prom2Q3UUY6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prom2Q3UUY6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prom2Q3UUY6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prom2Q3UUY6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms