Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chpf2Q3UU43 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chpf2Q3UU43 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chpf2Q3UU43 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chpf2Q3UU43 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms