Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B3gnt6Q3USF0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
B3gnt6Q3USF0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms