Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rmi2Q3UPE3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rmi2Q3UPE3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rmi2Q3UPE3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rmi2Q3UPE3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rmi2Q3UPE3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rmi2Q3UPE3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rmi2Q3UPE3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rmi2Q3UPE3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rmi2Q3UPE3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rmi2Q3UPE3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rmi2Q3UPE3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rmi2Q3UPE3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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